Proses belajar mengajar di SD Muhammadiyah Sapendiseimbangkan antara tiga ranah
pendidikan yaitu afeksi, kognisi, dan psikomotor sehingga diharapkan dapat menghasilkan
peserta didik yang mengusai keimanan dan ketakwaan (IMTAK) serta ilmu pengetahuan
(IPTEK) sesuai dengan visi dan misi sekolah.
Beberapa kegiatan penunjang dalam proses belajar mengajar adalah :
Pembinaan khusus membaca Al-Quran, dengan menggunakan metode Iqro' bagi kelas
1
Kelas PATAS/Akselarasi : diperuntukan bagi anak - anak yang memiliki kemampuan
di atas rata - rata
Bimbingan Psikolog : setiap sabtu dan kamis dihadirkan psikolog untuk siswa yang
mengalami hambatan
Tes Psikologi untuk siswa : Program ini untuk mengetahui tingkat IQ siswa dan
akan menentukan penanganan peserta didik secara berkelanjutan tes ini dilakukan
di kelas II
Tadarus dan Hafalan Al-Quran : Program ini dilakukan setiap pagi sebelum dimulai
pelajaran, mulai dari kelas I sampai kelas VI secara berjenjang
Pembinaan prestaasi : program ini menampung siswa yang memiliki keunggulan di
bidang Olimpiade Sains, Matematika, mata Pelajaran Bahasa, Seni, Olah Raga, Teknologi
Informasi
Field Trip : program ini merupakan program belajar siswa dengan tujuan siswa
dapat pengalaman langsung, Siswa belajar di tempat bersejarah, masyarakat sekitar,
pasar, agro, peternakan, laboratorium yang bekerjasama dengan fakultas Biologi,
Elektronika, Kedokteran Hewan UGM, dan tempat - tempat lain yang dapat memperkaya
keilmuan siswa
Outbound : program yang dilaksanakan setiap semester ini bertujuan untuk melatih
kerjasama, kreatifitas, dan menumbuhkan percaya diri.
Hiking : program yang bertujuan untuk mengenalkan alam kepada siswa serta mencintai
ciptaan allah
Camping : Perkemahan Keluarga BEsar SD Muhammadiyah Sapen (PERKASA) untuk kelas
V baik reguler maupun akselerasi yang dilaksanakan setiap tahun dengan tujuan
untuk melatih kemandirian, bertahan hidup, berakhlak mulia dan tangguh